একাডেমিক শাখার কর্মকর্তা-কর্মচারীগণ রাজশাহী বিশ্ববিদ্যালয়ের শিক্ষা সংক্রান্ত যাবতীয়  কাজ করে থাকেন। যেমন- ১মবর্ষ স্নাতক/স্নাতক (সম্মান) শ্রেণিতে ভর্তি পরীক্ষার প্রক্রিয়া সংক্রান্ত কাজ, ১মবর্ষ হতে মাস্টার্স শেষ বর্ষের ছাত্র/ছাত্রীদের পুন:ভর্তি, বিলম্বে ভর্তি, এম.ফিল/পি-এইচডি কোর্সের ভর্তি, বিদেশী ছাত্র/ছাত্রী ভর্তি, ভাষা সার্টিফিকেট কোর্সে ভর্তি, অধিভূক্ত সরকারী ও বেসরকারী কলেজ/ইনস্টিটিউট, সান্ধ্যকালীনসহ সকল রেজিস্ট্রেশন সংক্রান্ত যাবতীয় কাজ ও মাইগ্রেশন সার্টিফিকেট এই শাখা থেকে ইস্যূ করা হয়। এছাড়া ছাত্র/ছাত্রীদের বোর্ড বৃত্তি, অগ্রণী ব্যাংক স্বর্ণপদক, প্রধানমন্ত্রী স্বর্ণপদক, বিভিন্নদাতা সংস্থা কর্তৃক প্রদত্ত বৃত্তি প্রদান সংক্রান্ত কাজ, ক্লাস ও অফিস ছুটির বাৎসরিক তালিকা প্রস্তুত ও সকল ছুটির বিজ্ঞপ্তি প্রচার, শিক্ষা সফর ও ফিল্ডওয়ার্কের অর্থ বন্টন, শিক্ষকদের টিএ/ডিএ প্রদান সংক্রান্তি পত্র, রোভার স্কাউটস রেঞ্জার, বি.এন.সি.সি বৃত্তি, রেজিস্টার্ড গ্রাজুয়েট, ছাত্র/ছাত্রী বীমার কাজ এই দপ্তরে হয়।